يتميز نظام أسواق6 بنظام بنوك شديد التكامل والمرونة حيث يمكنه محاكاة الأساليب المختلفة للعمل حتى يكون قريباً من الأسلوب اليدوي الذي يستخدمه المحاسبون ، فيحتوى على دليل للبنوك المختلفة التي تتعامل معها المؤسسة مع إمكانية تعريف الحسابات المختلفة المفتوحة داخل البنك الواحد وبعملاتها المختلفة ، كما يمكن تعريف دفاتر الشيكات التي يتم الحصول عليها من البنوك المفتوح بها حسابات مع وضع التسلسل الخاص بالدفتر داخل النظام حتى يمكن الرقابة على الشيكات المصدرة داخل النظام.
و تحتوى الدورة المستندية على إشعارات لاستلام أو إصدار الأوراق التجارية يتم فيها تعريف البيانات الكاملة للورقة المالية من حيث البنك ورقم الورقة وقيمتها وتاريخ استحقاقها ومدة الصلاحية وخلافه.
تتصل الدورة المستندية مع الحسابات حيث يتم عمل سندات القبض أو الصرف لتلك الشيكات مما يؤثر مباشرة على الحسابات بشكل آلي وبالطريقة التي تستخدمها الشركة حيث تعتبر بعض الشركات أن استلام الشيك لا يجب أن يؤثر على حساب البنك حتى يتم صرفه وقد تعتمد بعض الشركات الأخرى خلاف ذلك أو الطريقتين سوياً، ويدعم أسواق6 جميع الأساليب التي تطبقها الشركات المختلفة ويساعد على إصدار القيود المطلوبة ومتابعة الدورة المستندية طبقاً للأسلوب المتبع في كل مرة مما يوفر الجهد المبذول من طرف المستخدم ويقلل احتمالات الخطاً عند الإدخال.
كما يمكن تظهير الشيكات المستلمة من أحد العملاء عن طريق إعادة صرفها مرة أخرى باستخدام سند صرف لنفس الشيك حيث يدعم النظام هذا الأسلوب ويسجل عملية التظهير داخل النظام ، أو يمكن إلغاء الشيك باستخدام سند خاص.
ويعتبر الإشعار البنكى هو أحد الخطوات الهامة التي تقوم بإنهاء الدورة المستندية للبنوك حيث يتم تسجيل بيانات الورقة المالية سواء صادرة أو واردة ورقمها وإدخال الحالة التي وصلت إليها طرف البنك سواء الوضع الطبيعي وهو التحصيل أو عملية رفض التحصيل أو الإجراءات القانونية ، وفى كل حالة من الحالات السابقة يقوم أسواق6 تلقائياً بمتابعة الدورة المستندية التي وصل إليها الشيك ثم إغلاقها بالطريقة المناسبة للحالة التي تم اختيارها.
كما يدعم أسواق6 عملية تحصيل أو سداد الشيكات بالعملة الأجنبية حيث يوجد حقل خاص في مستند الإشعار البنكى يتم إدخال مبلغ التحصيل أو السداد الفعلي به ويقوم أسواق6 تلقائياً بعمل القيد اللازم وتحويل الفروق إلى الحسابات الخاصة بها.